Jane, Red John olduğunu ileri süren Tim Carter’ı vurduktan sonra tutuklanmayı bekler. Tüm ekip askıya alınır. Ancak Jane’in şüpheleri vardır, Tim’in gerçekten Red John olup olmadığı konusunda. Kanıtlar kurbanın masum bir adam olduğunu gösterir.

Jane mahkemede suçsuz bulunarak CBI’a danışman olarak geri döner. Kıdemli ajan Ray Haffner’ın ekibine katılarak öldürülen eski bir fitness antrenörünün davasına bakar. Lizbon hala askıda olduğu için eski ekip bu davayı Jane’in liderliğinde kendi başlarına çözmeye çalışır. Ancak bu durum Ray’in ekibi ile aralarında sıkıntı yaratır.

9 yaşındaki bir çocuk kaçırılır. Annesi, Jane’in eski müşterilerinden biridir ancak Jane’in terapi yöntemlerine inanmadığı için başka bir terapistle çalışmaya başlamıştır. İşin ilginç yanı, çocuğun kaçırılma olayındaki tüm ipuçları yeni terapiste işaret eder!

Jane ve ekibin diğer üyeleri yeni patronlarıyla tanışmaya giderler. Katıldıkları siyasi mitingde Jane, karşılaştığı bir adamın seri katil olduğunu kanıtlamaya çalışırken Lisbon, aynı mitingde itirafçı olan bir katilin suçsuz olduğunu ispatlamaya çalışır.

CBI ekibi, Kaliforniya sahilinde bulunan San Felix adasındaki bir cinayeti çözmek için görevlendirilir. Ekip kurbanın geçmişini araştırırken katilin, babasından intikam almak isteyen bir korucu çocuğun olabileceği ipuçları elde eder.

Resort kasabasındaki Fairmont polis şefi Marnie Green öldürülür. CBI ekibi cinayeti çözmeye çalışırken Lisbon’ın ödül avcısı kardeşinin takip ettiği adam şüpheli olunca o da ister istemez soruşturmaya dahil olur. Şüpheliler arasında Rus uyuşturucu kaçakçıları da işin içine girince işler biraz karışır!

CBI bir seri katilin peşindedir. Jane, davayla ilgilenen, takıntılı bir blog yazarının katil olabileceğinden şüphelenir. Bunu kanıtlamak için yine kendine has yöntemler kullanacaktır.

CBI bir uyuşturucu satıcısının peşindeyken, bir gece kulübünün dışında uyuşturucu satıcısı öldürülür. Ekip katilin peşine düşer.

Emekli bir profesyonel oyun kurucunun asistanı bir araba kazasında ölür. Kaza sonrası araştırma yapan ekip, bu kazada aslında asistanın değil oyuncunun hedef alındığını anlar. Şüpheliler arasında oyuncunun eski bir takım arkadaşı vardır.

Başarılı bir itfaiyeci olan Paul Satterfield öldürülüp, cesedi bataklığa atılır. Soruşturma için bölgeye gelen ekip araştırma yaparken Jane saldırıya uğrar ve kısa süreli bir hafıza kaybı yaşar. Cinayette tüm gözler öldürülen itfaiyecinin karısındadır. Katili ortaya çıkarmak için Jane bir tuzak hazırlar.

Ekip boşanma avukatının ölümünü soruştururken Jane, Red John'un hâlâ hayatta olabileceğini keşfeder ve çok fazla soru soran bir FBI ajanından şüphelenir.

CBI, bir suç örgütü patronunun oğlunun cinayet davası ile ilgili araştırma yapar. Bu sırada Grace, bir katilin peşinden giderken saldırgan bir tanıkla tek başına kalması sorun çıkarır.

Ünlü bir moda tasarımcısı yeni koleksiyonuna hazırlanırken öldürülmüş olarak bulunur. Diğer taraftan Ajan Darcy, Jane’in öldürdüğü adamın Red John olmadığını ispat eder.

Patrick cinayetten yargılanan bir kadının masum olduğuna inanır ve jüri üyeleri müzakerelerine tam başlarken Lizbon'ı soruşturma açma konusunda ikna eder.

Patrick'in kurtarmaya yardımcı olduğu bir katil, CBI'nin bir cinayeti çözmesine yardım edebilecek bilgilere sahiptir. Ancak aralarındaki romantik çekim, soruşturmaya müdahale edebilir.

Bir tarikat liderini canlandırmaya çalışan adam öldürülür. Patrick tarikat üyelerinin bu cinayette bir parmağı olduğunu düşünür ve katili ortaya çıkar.

CBI, bir cinayet işlediğini itiraf eden kendini beğenmiş bir işletme sahibini bulmaya çalışırken, FBI ajanı Darcy, Jane'in cinayet soruşturması için yardım ister. Onun asıl amacı, Jane’in Red John ile olan ilişkisi hakkında daha fazla bilgi edinmektir.

CBI, sadece bir kaç hafta yaşamı kalmış kanser hastasının neden ve kimin öldürdüğünü anlamaya çalışırken, Cho'nun bağımlılığı sahada az kalsın geri dönüşü olmayan bir hataya sebep olur.

Jane eski bir sihirbaz arkadaşının kaçırılan kız arkadaşını kurtarmak için çalıştığı kumarhaneyi soymaya zorlandığını keşfeder. Ona yardım etmeye çalışır.

Bir lisede, ingilizce öğretmeni cinayetinin araştırılması Jane'e, oyunculuk becerilerini bir drama sınıfında sergileme fırsatı verir.

Summer, bir sörfçünün ölümüyle ilgili soruşturma yaparken, Lizbon’ın eski anıları canlanır. Bu arada Summer, Cho ile ilişkisini etkileyecek bir karar verme aşamasındadır.

Jane, Red John'u bulmaya çalışmaktan vazgeçmeyi düşünüyor olsa da, cinayet zanlılarının itiraflarını almaya yönelik alışılmışın dışındaki yöntemleri sonunda çizgiyi aşmış olabilir.

Jane, CBI’dan ayrıldıktan sonra Las Vegas’a giderek eğlence dünyasına girer ve Red John’un peşinden artık koşmadığı izlenimini vermeye çalışır. Aslında bütün bu olanlar yeni planının bir parçasıdır.