Müzenin tozlu koridorlarında her zamanki kovalamacalarına devam eden Tom ve Jerry, beklenmedik bir keşifle karşılaşır. Peş peşe yaşanan hareketli anlar sırasında gözlerden uzak bir köşede duran gizemli bir pusula, ikilinin dikkatini çeker.

Ancak bu sıradan bir pusula değildir; üzerindeki karmaşık semboller ve yaydığı esrarengiz ışıltı, onu farklı kılar. Meraklarına yenik düşen ikili, pusulayı ellerine aldıklarında beklenmedik bir olay gerçekleşir.

Pusula aniden parlamaya başlar ve Tom ile Jerry'yi sarmalayan bir zaman girdabı oluşur. Göz açıp kapayıncaya kadar kendilerini bambaşka bir çağda bulan ikili, tanımadıkları bir dünyanın içinde bulur.

Artık alışık oldukları modern müzeler ve evler yoktur; yerini bilinmedik kıyafetler, yabancı diller ve tuhaf gelenekler almıştır. Bu yeni zamanda hayatta kalabilmek için Tom ve Jerry'nin aralarındaki bitmek bilmeyen rekabeti bir kenara bırakması gerekir.

Zaman yolculuğunun şaşkınlığı içinde, pusulanın onları bu çağa getiren bir anahtar olduğunu anlarlar. Ancak asıl sorun, pusulayı kullanarak kendi zamanlarına dönmenin bir yolunu bulmaktır.

Bu arayış, onları bu dönemin tehlikeleri ve sırlarıyla dolu bir maceraya sürükler. Tom ve Jerry, birbirlerine güvenmeyi öğrenirken, pusulanın gizemini çözmek ve eve dönüş yolunu bulmak için zamana karşı bir yarışa girer.