Yıllarca sahte hayaletlerin ve maskeli canavarların peşinden koşan Scooby-Doo çetesi, artık yollarını ayırmıştır. Daphne başarılı bir televizyon programı sunarken, Fred onun doğum günü için ekibi Louisiana’ya bir araştırma gezisine götürür. Bu gezi, arkadaşlık bağlarını yeniden canlandırırken, gerçek bir doğaüstü olayla karşılaşma umuduyla Ölüler Adası’na yönelmelerine neden olur.

Adada gizemli bir plantasyon sahibi ve çalışanlarıyla tanışan çete, kısa sürede tuhaf olaylarla sarsılır. Bu kez karşılaştıkları tehlikenin sahte olmadığını anlarlar: adanın derinliklerinden çıkan gerçek zombiler tarafından kuşatılırlar. Scooby ve arkadaşları, bu saldırıların arkasında adayı lanetleyen bir korsan hayaleti ve onun kontrolündeki öfkeli kurt kedilerin olduğunu keşfeder.

Hayatta kalmak ve adanın sırrını çözmek için birlikte çalışmak zorunda kalan çete, şimdiye kadar karşılaştıkları en gerçek ve en korkutucu macerayı yaşar. Bu yolculuk, onların dostluğunu sınarken, doğaüstüyle yüzleşmenin ne demek olduğunu da öğretir.