Scooby-Doo ve Sırlar Şirketi, Daphne'nin kuzeni Fiona'yı ziyaret etmek için İskoçya'daki Loch Ness Gölü kıyısında bulunan Blake Şatosu'na gider. Ancak huzurlu bir tatil beklerken, efsanevi Loch Ness Canavarı'nın yeniden ortaya çıkmasıyla her şey değişir. Şatonun gizemini çözmek için canavarı yakalamaya takıntılı bilim insanı Penelope Miller ile iş birliği yaparlar.

Bu sırada Scooby-Doo ve Shaggy, tesadüfen sergiledikleri fiziksel beceriler sayesinde geleneksel İskoç Highland Oyunları'na katılmaya ikna edilir. Oyunların Blake Şatosu'nda düzenlenecek olması heyecanı artırırken, Nessie'nin oyunları sabote etme tehdidi ortaya çıkar. Scooby ve Shaggy'nin komik çabaları, bu tehlike karşısında gölgede kalma riski taşır.

Gizem Şirketi, şatonun karanlık koridorlarında ve sisli İskoç kıyılarında ipuçlarını takip ederek canavarın sırrını çözmeye çalışır. Gerçek ve efsane arasındaki çizgi bulanıklaşırken, dostluk ve cesaret bu gizemli ortamda her zamankinden daha önemli hale gelir.