Scooby-Doo ve arkadaşları, bir korsan hikayesi festivalinde karşılaştıkları esrarengiz bir hayaletin peşine düşer. Bu hayalet, onları gizem dolu bir hazine haritasının sırlarını çözmeye yönlendirir. Ekip, tarihi bir define arayışına atılırken bir yandan da korkutucu hayaletten kaçmanın yollarını arar.

Gizemli adalar ve labirent gibi mağaralarda ilerleyen çete, her biri farklı zorluklar içeren bölümlerde yol alır. Shaggy ve Scooby’nin yemek molaları bile beklenmedik ipuçlarına dönüşürken, diğer üyeler bulmacaları çözmek için zekalarını kullanır. Ancak her adımda hayaletin gölgesi onları takip etmektedir.

Haritanın sonuna ulaştıklarında, gerçek hazinenin sandıklardaki altınlar olmadığını keşfederler. Yol boyunca edindikleri dostluklar ve takım çalışması, asıl değerli ganimet haline gelir. Bu süreçte hayaletin arkasındaki sürpriz gerçek de ortaya çıkarak tüm esrarı çözer.