Lise öğrencileri Fred, Daphne, Velma, Shaggy ve köpeği Scooby, okullarında yaşanan doğaüstü olaylarla karşılaşır. Okulun bodrum katında beliren hayaletler ve esrarengiz olaylar, öğrencileri korkuya boğar. Bu beş karakter, şüphelerini birleştirerek ilk kez bir ekip olarak gizemi çözmeye karar verir.

Grup, okulda dolaşan hayalet efsanelerini ve garip ipuçlarını takip ederek kampüsün karanlık köşelerine yönelir. Her biri kendi yeteneklerini keşfeder: Fred doğal liderliğini, Daphne araştırma becerilerini, Velma analitik zekasını, Shaggy ve Scooby ise beklenmedik cesaretlerini ortaya koyar. İpuçları onları okulun gizemli tarihine doğru sürükler.

Ekip, gerçekle yüzleşmek için cesaretlerini toplar ve okulun tarihini araştırarak tuhaf olayların perde arkasını çözmeye çalışır. Her buldukları ipucu, gizemi aydınlatırken aralarındaki dostluk bağlarını da güçlendirir. Bu macera, birlikte çözecekleri sayısız gizemin sadece başlangıcıdır.