Ash, Goh ve Dawn, efsanevi Pokémon Arceus'un sırrını araştırırken kendilerini beklenmedik bir maceranın içinde bulurlar. Antik bir kehanet ve gizemli bir taş tablet, onları geçmişle bugün arasında bir yolculuğa çıkarır.

Bu keşif gezisi sırasında, Team Galactic adlı kötü niyetli organizasyonun tehlikeli bir planını ortaya çıkarırlar. Grubun lideri Cyrus, Arceus'un gücünü ele geçirerek tüm dünyayı yeniden şekillendirmeyi amaçlamaktadır.

Kahramanlarımız, zamanın derinliklerinden gelen bu tehdidi durdurmak için tüm becerilerini ve dostluklarını seferber etmek zorundadır. Arceus'un kadim gücü ile yüzleşmek, onları şimdiye kadarki en zorlu mücadelelerinden birine sürükleyecektir.