Pete, ormanın derinliklerinde yalnız başına yaşayan küçük bir yetimdir. Ona bu vahşi doğada eşlik eden tek dostu, tüylü yeşil bir ejderha olan Elliott'tur.

İkili, görünmez olma ve uçma gibi büyülü yetenekleri sayesinde, birbirlerine sıkı sıkıya bağlı, kendi dünyalarında mutlu bir hayat sürer. Bu gizli düzen, Pete'in bir gün kasaba halkı tarafından keşfedilmesiyle bozulur.

İnsanlarla teması uzun zaman önce kesmiş olan Elliott, ortadan kaybolur. Pete ise kendisini, deniz fenerinde yaşayan Grace ve babası Bay Meacham'ın şefkatli bakımı altında bulur.

Ancak Pete'in kalbi, kayıp dostunu aramak ve onu geri getirmek için tutuşmaktadır. Pete, yeni tanıştığı Natalie'nin de yardımıyla, Elliott'ı bulmak için yeniden ormana döner.

Fakat ejderhanın varlığı, kasabada bazılarında korku, bazılarında ise kontrol etme arzusu uyandırır. Pete, gerçek bir aile bulma umudu ile en eski ve en sadık dostunu koruma arasında bir seçim yapmak zorunda kalır.