Edward ve Alphonse Elric, annelerini kaybetmenin acısıyla yasak bir simya deneyine girişirler. Bu umutsuz girişim korkunç bir bedelle sonuçlanır: Alphonse tüm bedenini kaybederken, Edward da sağ kolunu yitirir.

Edward, kardeşinin ruhunu kurtarmak için sol bacağından da vazgeçerek onu devasa bir zırhın içine hapsetmeyi başarır. Bu trajik olayın ardından iki kardeş, kaybettikleri bedenlerini geri kazanmanın tek yolu olduğuna inandıkları efsanevi Filozof Taşı'nı aramak için yola koyulur.

Yolculukları, onları ülkenin dört bir yanına sürüklerken karşılaştıkları tehlikeler ve sırlar, simyanın sınırlarını ve bedellerini sorgulamalarına neden olur. Elric kardeşlerin mücadelesi, sadece fiziksel bedenlerini değil, aynı zamanda insanlıklarını ve birbirlerine olan bağlarını koruma çabasına dönüşür.

Her adımda, gücün ve bilginin sorumluluğuyla yüzleşirken, geçmişlerinin gölgesinden kurtulmaya çalışırlar.