Lego Batman, görkemli malikanesinde yalnız başına geçirdiği günlerde kendini süper kahramanlıktan çok rahatlığa adamış durumdadır. Ancak bu düzen, enerjisiyle herkesi şaşırtan genç Dick Grayson'ın Robin olarak hayatına girmesiyle sarsılır.

Üstelik, yetenekli ve kararlı Barbara Gordon da Batgirl kimliğiyle Gotham'ın koruyucuları arasına katılır. Yeni kurulan bu ekip, henüz birbirlerine alışmaya çalışırken çok daha büyük bir tehditle karşı karşıya kalır.

Joker, bu kez tüm şehri alt üst edecek kadar hain bir planı devreye sokmuştur. Gotham'ın kaderi, bu uyumsuz üçlünün omuzlarına yüklenir.

Batman, alışılagelmiş yalnız kurt tavrını bir kenara bırakmak zorunda kalır. Robin ve Batgirl ile birlikte, sadece fiziksel değil duygusal anlamda da bir takım olmayı öğrenerek Joker'in karmaşık komplosunu durdurmaya çalışacaktır.