Koralin, ailesiyle taşındığı eski ve kasvetli evde can sıkıntısından kıvranmaktadır. Ebeveynlerinin ilgisizliğiyle baş başa kalan meraklı kız, evde keşfe çıktığında duvarda gizemli bir kapı bulur. Bu kapının ardında, kendi dünyasının neredeyse aynısı olan büyüleyici bir yer keşfeder. Alternatif dünyada Öteki Anne ve Öteki Baba ona aşırı şefkatli davranır, her istediği gerçek olur ve etraf rengarenktir. Ancak bu mükemmel dünyadaki herkesin gözlerinin yerinde tüyler ürpertici bir şekilde düğmeler vardır.

Öteki Anne, Koralin’i sonsuza kadar burada kalmaya ikna etmeye çalışır. Ona hiç sıkıntı çekmeyeceği, her arzusunun yerine getirileceği bir hayat vaat eder. Fakat Koralin bu teklifi içgüdüsel olarak reddeder ve gerçek dünyasına dönmek ister. Bu reddediş, Öteki Anne’nin gerçek doğasını ortaya çıkarır. Alternatif gerçeklik bir kabusa dönüşür ve Koralin bu sinsi dünyadan kaçması gerektiğini anlar.

Kapana kısılan Koralin, sadece kendi özgürlüğü için değil, Öteki Anne’nin tuzağına düşmüş diğer ruhlar için de mücadele etmek zorundadır. Gerçek ailesine kavuşmak ve bu korkunç dünyadan kurtulmak için zekasını ve cesaretini kullanmalıdır. Karşısına çıkan tehlikelerle yüzleşen Koralin, sevginin ve ailenin gerçek anlamını keşfeder.