Sekiz yaşındaki canlı ve neşeli Heidi, İsviçre Alpleri'ndeki tenha dağ kulübesinde huysuz büyükbabası Alm-Öhi ile yaşamaktadır. Tatilde arkadaşı Clara'yı Baltık Denizi kıyısında ziyaret etmeyi hayal ederken, planları beklenmedik bir keşifle alt üst olur: Açgözlü iş adamı Schnaittinger'in tuzağına düşmüş yaralı bir vaşak yavrusu bulur.

"Peps" adını verdiği küçük hayvanı büyükbabasından gizlice sağlığına kavuşturan Heidi, onu dağlardaki ailesine geri götürmeye karar verir. Ancak Schnaittinger'in güzel dağ manzarasına dev bir kereste fabrikası kurma planları köy halkını baştan çıkarmakta, vaşakları yok etmek için tuzaklar kurmaktadır.

En yakın arkadaşı keçi çobanı Peter ile birlikte Heidi, hem sevimli vaşak ailesini hem de büyükbabasının şerefini hem de sevdiği doğayı korumak için mücadeleye atılır. Johanna Spyri'nin zamansız karakterlerini modern bir çevre koruma mesajıyla buluşturan bu animasyon film, küçük izleyicilere doğa sevgisi ve cesaretin önemini sıcak bir anlatımla aktarıyor.