On bir yaşındaki Jonathan Kent, babası Süpermen gibi olağanüstü güçlere sahip olduğunu keşfederken, Batmanin oğlu Damian Wayne de bir savaşçı olarak yetişmektedir. İki genç kahraman, farklı dünyalardan gelseler de kendilerini beklenmedik bir ortak tehdidin karşısında bulur. Dünya, insanlığı kontrol altına alarak gezegeni ele geçirmeye çalışan kötü niyetli uzaylı varlık Starronun istilası altındadır.

Bu kaotik ortamda Batman ve Süpermen de tehlikeli bir duruma düşer ve babalarını kurtarmak için Jonathan ile Damianın iş birliği yapması kaçınılmaz olur. İki süper oğul, aralarındaki kişilik farklılıklarını bir kenara bırakarak benzersiz yeteneklerini birleştirmek zorunda kalır. Jonathanın yeni keşfettiği güçleri ve Damianın eğitimli savaş becerileri, bu amansız düşmana karşı tek umutlarıdır.

Birlikte hareket eden Jonathan ve Damian, insanlığın kaderini belirleyecek bir mücadeleye girişir. Starronun kontrolündeki dünyayı kurtarmak ve babalarını özgürlüğüne kavuşturmak için her şeylerini ortaya koyan iki genç kahraman, gerçek birer kahraman olmanın ne demek olduğunu öğrenir.